بعضی از حوزه های فعالیت دانش آموختگان رشته مهندسی پزشکی در ذیل آمده است:
• طراحی و ساخت تجهیزات و وسایل پزشکی
• نصب و راه اندازی دستگاهها و وسایل پزشکی و تجهیز فنی بیمارستان
• ارتقاء و به روزرسانی عمل کرد دستگاه ها و تجهیزات پزشکی فعلی
• تعمیر و نگهداری تجهیزات بیمارستانی
• مشاوره فنی در سفارش و خرید دستگاههای پزشکی
• کمک به کادر پزشکی در به کارگیری بهینه از دستگاههای پزشکی و تفسیر نتایج پزشکی
• مسئولیت فنی و مهندسی بیمارستان
• همکاری در پروژه های تحقیقاتی پزشکی
• استفاده از تکنیک های مهندسی بافت در ارتقاء کیفیت و سرعت التیام و بازسازی بافت های آسیب دیده
• طراحی و بهینه سازی رهایش دارو
• طراحی و ساخت تجهیزات ورزشی• طراحی و ساخت تجهیزات توانبخشی• توسعه الگوریتم ها و نرم افزارهای مرتبط جهت رفع نیازهای آموزشی و پژوهشی مراکز بهداشتی، پزشکی، سرم سازی، ژنتیک، داروسازی و ....• طراحی و توسعه نرم افزارهای لازم جهت ارتقاء کیفیت تصاویر پزشکی